刚从星际图书馆的混乱中脱身，众人还没来得及喘口气，就被一道炫目的光墙围住。任务派发员再次现身，这次他穿着一件滑稽的巫师袍，帽子上还插着一把会冒火花的魔法扫帚：“干得不错嘛！不过，星际图书馆还有个隐藏危机没解决。有一群捣蛋的小精灵偷走了关键的‘知识结晶’，要是不找回来，整个图书馆的知识体系就要崩溃啦，到时候宇宙所有文明都会陷入混乱，祝你们好运，记得小心那些会恶作剧的小家伙！”说罢，他挥一挥手中的魔杖，众人的装备再次变形。
奇遇的自动翻书器变成了能探测知识结晶的魔法罗盘，指针疯狂旋转，指向图书馆深处；小奶娃的电子检索仪化作一个会说话的水晶球，不停地念叨着：“向左走，再向右，小心脚下有陷阱哦！”奇葩的披萨盒机甲则长出了一对巨大的蝴蝶翅膀，带着他在书架间飞来飞去，只是每扇动一下翅膀，就会洒下五彩的亮片和“噼里啪啦”的小鞭炮；阿花的平底锅书签变成了一个能发出强大吸力的魔法吸尘器，专门用来捕捉小精灵；胖小子的移动书架装上了涡轮增压引擎和机械手臂，变成了一辆超级搜索车，还能发射泡泡糖子弹来困住目标。
众人沿着罗盘的指引，小心翼翼地前进。突然，一只全身闪烁着七彩光芒的小精灵从书架后飞了出来，冲着他们做了个鬼脸，然后丢出一个烟雾弹。瞬间，整个通道被紫色烟雾笼罩，还伴随着刺鼻的臭鸡蛋味。“咳咳，这味道比阿花的黑暗料理还可怕！”奇葩捏着鼻子大喊。
奇遇挥动魔法罗盘，试图驱散烟雾，却不小心触发了小精灵设下的陷阱——地面突然变成了巨大的蹦床，把他们弹得东倒西歪。领头天马刚落地，就被一根从天而降的绳子套住了脖子，像风筝一样被吊了起来，在空中拼命挣扎。
小奶娃通过水晶球发现，这些陷阱都是由小精灵们用恶作剧魔法布置的，只有找到它们的魔法源头才能破解。胖小子驾驶着超级搜索车，在烟雾中横冲直撞，用泡泡糖子弹射击可疑的角落。终于，他发现了一个藏在书架顶端的魔法盒子，刚伸手去拿，盒子突然喷出胶水，把他的机械手臂粘得死死的。
阿花见状，启动魔法吸尘器，强大的吸力把小精灵们都吸了过来。可小精灵们十分狡猾，在吸尘器里左躲右闪，还不停地丢出各种小玩意儿干扰阿花，一会儿是会爆炸的橡皮鸭，一会儿是会咬人的毛绒玩具。
奇葩操控着长翅膀的披萨盒机甲，在烟雾中寻找知识结晶的下落。他发现一只小精灵正抱着知识结晶，在书架间穿梭。奇葩紧追不舍，却被小精灵用彩带绊倒，摔了个狗啃泥。
关键时刻，奇遇发现魔法罗盘的指针指向了自己的口袋。他伸手一摸，竟然掏出了一颗闪闪发光的知识结晶。原来，刚才烟雾弥漫时，小精灵慌乱中把知识结晶塞进了他的口袋。
随着知识结晶被找到，陷阱和烟雾瞬间消失，图书馆恢复了平静。任务派发员又冒了出来，宣布任务圆满完成，奖励是一次在星际图书馆任意借阅的机会。可还没等众人挑选书籍，一阵强烈的震动传来，图书馆的墙壁上出现了一道道裂缝，似乎有更强大的危机正在逼近……