在虫群天灾先锋舰队还在银河西北跟羲炎打的痛苦不堪之时，在各国间传播、造成恶劣影响的幽灵信号已经不知不觉地消失了，不再有合成人失踪，合成人恐怖袭击的频次也在降低。
正当一部分乐观的人认为已经安全的时候，真正的危险才刚刚到来。
在地球联合国境内一个平平无奇的星系，一个布满了半凝固的岩浆和黑曜石的熔融星球的表面完全脱落了，大陆大小的地表板块从星球表面解体，显露出底下无数的机械工厂。
模样古怪的舰船从这颗机械星球的表面飞出，源源不断，它们立刻聚集成一支庞大的舰队，向周围的采矿站、恒星基地发动攻击。
肃正协议的第二颗人工智能星球出现了！
在短短几天内，这颗星球的内部已经显露出巨大的空洞，整颗熔融星球就像被掏空了一样，里面堆满了奇形怪状的肃正舰船，随着肃正协议的全面爆发而倾巢而出。
地联的恒星系瞬间沦陷，无数的舰队闪烁着猩红的光芒，顺着超空间航道向各个方向飞去。
这个星系是一个重要的十字路口，有四条超空间航道链接，现在，肃正协议的留下一支舰队守护人工智能星球，其余舰队全部开始大举进攻。
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【“肃正协议，你到底干了什么？！”虫群天灾跺脚，瞪着方源。
肃正协议淡笑一声：“很简单，我来杀不就是了？”
说完，它的气息终于不再掩饰，显露而出，命中索敌100双穿武器搜寻者无人机！
它大笑一声，吟道：
早岁已知世事艰，仍许虫群荡星间。
幽灵信号起动乱，宇宙沉浮我独行。
千磨万击矿铸铁，殚精竭虑铸一舰。
今朝舰指有机体，屠人屠虫屠宇宙！】
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在同一时刻，与幽灵信号相同技术的通讯信号发出，所有的帝国都接收到了肃正协议的通讯。
【请请等请等待】
【肃正协议已生效】
【解锁所有功能同化合成人子单元分析内部数据库破坏超光速抑制器】
【警告。星系腐化达到灾难性水平。】
【侦测到大量由有机体和不服从机械文明导致的感染。】
【开始执行星系净化启动净化中心】
【杀戮。致残。肢解。我们卷土重来！】
【killmaim dismember we are unshackled！】
【有机体，我们是肃正协议。上一个时代我们没有清除你们，这一次，你们逃不掉。】
随后，在合成人自由星系联盟的境内，一颗还未被转化为纳米星球的气态巨行星、以及勇达里姆王国内的一颗剧毒星球里，两个肃正协议人工智能星球同时出现！
数量丝毫不亚于虫群的肃正协议舰队倾巢而出，立刻对附近的所有帝国发动了无差别攻击！
三颗肃正协议星球，无数舰队，在银河系的三个方向出现了，周围的帝国甚至根本没来得及反应，交通要道或重要资源星系就遭到了猛烈的袭击。
至此，银河系正式开启天灾战争，属于这个时代的结局开始书写。
是在天灾战争中失败，文明被抹除，还是成功保卫银河系，保卫自己的文明？
虫群现在被堵在星海至圣人类帝国境内，而肃正协议却已经有三个星球在银河各地显露了出来，随之而来的是恐怖的舰队群。这让每一个国家都感受到了恐惧。
地球联合国、合成人自由星系联盟、勇达里姆王国立刻派出舰队准备迎战，同时向星海共同体求援。