北柱将军总制北线，驻兵山西沁州。
主将田见秀，授月芒将军衔，副将为郭绍、惠登相，杨彪。
他们统领原汝云军、泽云军，承云军和大顺军重甲铁骑，共计十万兵马，统称北柱军。
北柱军的权责，是镇守山西，封锁黄河北岸，确保山西泽潞沁的安全，防止清军大举南下进攻。
南柱将军总制南线，驻兵九江。
主将为李国英，星锐将军衔，副将为袁宗第、姜云升，周如立。
他们掌原浔元军、归云军、大顺军水师，共计八万兵马，统称南柱军。
南柱军主要镇守江西湖广，封锁长江流域，防止东西两路清军的夹击。
西柱将军总制西线，驻兵洛阳。
然而，洛阳现下尚在清军图赖手中，大军暂时只能驻登封。
主将为左梦庚，月芒将军衔，副将罗洪、郝摇旗、金声桓。
他们统领原黄云军、开云军、德云军、大顺军轻骑兵一部，共计十万兵马，统称西柱军。
西柱军主要防御方向为陕西清军、南阳府的刘洪起的南明军，并驱逐盘据洛阳的图赖清军。
东柱将军总制东线，驻兵归德府。
主将为刘芳亮，月芒将军衔，副将岳明轩、马进忠、刘体纯。
他们掌原岳云军、武云军、大顺军两部，共计十万兵马，统称东柱军。
东柱军负责防御东部清军的进攻，同时支援南明军队抗清。
中柱将军总制中线和战略机动，驻兵开封府。
主将孙明远，月芒将军衔，副将王允成、杨鼎勋、卢鼎。
他们掌领原向云军、郧云军、襄云军、荆云军，共计十万兵马，统称中柱军。
中柱军负责汝宁府周边的防御和开封怀庆府以北对清军的防御。
上柱将军主事各重火器装备，驻军汝阳。
主将吴初，月芒将军衔，副将卢光祖、于大忠。
他们掌领原巴云军、岳云军一部、火炮军，共计四万兵马，统称上柱军。
上柱军负责夏王府所在地安全，配合各路大军的战斗。
在武臣六柱制中，周云在每柱中都混入各方军队势力，各柱麾下三大参将，必有一人来自其他派系。
这样，既能让他们互相制衡，又能相互协同，以达到尽快融合为一体的目的。
在设定武臣六柱将军制的同时，周云又设立了三符验兵和支粮制。
每柱调兵虎符皆缺角，调兵需同时持将军符（如北柱虎符）、军机符（如军机参赞院调兵令）、还须合王印方能生效。
支粮或军资需同时持军机参赞院的盐印，户部的粮印，工部的铁印，三印合一才能支取军资。