另一边。
美国nerv支部基地下方。
佐奥·杰弗逊站在装着营养液的透明容器前，看着里面的白发少年。
“是率先使用你呢还是向系统寻求帮助呢？”
“不论怎么说，奥特曼都是不应该存在的。”
他站在容器前，背着双手，不断思索着。
eva初号机内部。
“真嗣真嗣”
温柔的声音越来越清晰。
毫无疑问，这就是初号机发出的声音。
以心灵感应的形式，传到了真嗣的脑海里。
“你是谁？”夏树同样以心灵感应回应。
这句话说出去后。
初号机驾驶舱内的场景瞬间变换，他们来到了一片纯白的精神空间之中。
“已经长大了呢，真嗣。”一位穿着白色研究服，留着栗色短发，面容格外美丽的女人出现在夏树面前。
碇唯
她不是在和夏树说话，而是在和夏树身后的真嗣说话。
“你是母亲！？”真嗣看向面前的女人，母亲的面孔他已经记不清了，但是这股强烈想要与对方拥抱的感觉，错不了的她就是自己的母亲。
“母亲！”真嗣直接迈开脚步，朝着碇唯跑去。
想要与其拥抱，但是却直接穿过了她的身体，仿佛那只是一个幻影。
“为什么？”真嗣愣愣的回过头，看着碇唯的虚影，心情一下子从喜悦跌落。
碇唯转过身，用温柔的目光看着他。
“现在还不行哦，真嗣。”
“我不能从初号机中出来。”
真嗣完全不能理解这样的话。
急忙说：“可以的！”
“夏树先生愿意帮助我们！”
“他是非常热心善良的人，而且还有神奇的力量，这段时间夏树先生帮助了我非常多，而且也答应了会复活母亲！”
这一刻，真嗣就是一位想要见到母亲的孩子。
“是吗。”
“真嗣他承蒙您照顾了。”听着真嗣的话，碇唯转头看向夏树，弯腰致谢道。
真嗣两次驾驶初号机时的场景，她都见到了。
只不过，仅限于真嗣坐在驾驶舱里的场景。
之后，她向两人解释了自己为什么要继续留在初号机内。
“seele的计划，是想要让所有人失去形体，成为一个完整的个体，而这样也会让人们失去‘自我’。”
“我不赞成这样的计划，但是仅凭我一个人的力量，是无法反抗seele的。”
“所以我在初号机的实验中，选择了将自己的灵魂留在这里，赋予初号机灵魂。”
“只有这样，真嗣你才能驾驶初号机，最后，也将获得决定这个世界走向的权利。”
初号机当年的实验，根本就不是意外。
是碇唯有意为之。
她想要以身入局，阻止seele的计划，并且将最后的选择权留给自己的儿子。
如果一切没有发生意外，最后真嗣会在一次次崩溃中成长，seele在失去重要的棋子后会将真嗣和初号机当做成神的钥匙，让真嗣完成最终的补完仪式。
而碇源堂的计划，也是注定会失败的。
这是一个真真正正在幕后推导着一切的女人，她不认同seele的计划，她想要的，是利用eva的技术，让人类实现真正的永生，在宇宙永远留下存在过的证明。
按照她原本的计划，真嗣最后会面临两个抉择，实现seele的愿望完成人类补完计划，让人类成为一体，或是拒绝seele，拒绝补完，让世界恢复原样，而初号机作为永恒的存在，在宇宙中永远流浪。
听完这些话。
真嗣懵了。
这都什么跟什么？
一个个的，怎么都弄出一大堆复杂的计划？
如果是以前的真嗣，在听碇唯说完这些话后，必定会陷入迷茫，不知道自己该如何做出选择。
但现在。
碇真嗣只是来到碇唯面前，语气坚定的说：“母亲的计划，与我无关！”
“我的选择，就是让母亲复活，作为母亲，陪伴在我身边！”
“而seele的计划，我和夏树先生一定会将它们粉碎的！”