战斗的胜利让联军和银河守护者联盟的士气高涨，但他们没有被眼前的胜利冲昏头脑，因为他们深知，要真正拯救宇宙，就必须揪出黑暗联盟背后的幕后主使，彻底解开这一系列阴谋的真相。
在清理战场的过程中，杨建波发现了一些奇怪的线索。一些战舰残骸上刻着一种古老而陌生的符号，这些符号与他在黑色能量遗迹中见到的某些标记有几分相似。经过仔细研究，他发现这些符号似乎指向了一个隐藏在宇宙深处的神秘空间。
“这些符号很关键，也许它们能指引我们找到黑暗联盟的真正老巢。”杨建波说道，他带领着一支精英小队，顺着符号所指的方向，踏上了探寻真相的旅程。
经过一番艰难的航行，他们终于来到了符号所指的神秘空间。这个空间的景象超乎想象，光线呈现出一种奇异的扭曲状态，仿佛时间都在这里变得混乱。空间的中心有一个巨大的能量漩涡，漩涡中散发着令人恐惧的黑暗力量。
杨建波等人小心翼翼地靠近能量漩涡，此时，周围突然出现了一些虚幻的身影，这些身影像是由黑暗能量凝聚而成，它们散发着诡异的气息，向联军战士们发出攻击。经过一番激战，联军凭借着智慧和力量暂时击退了这些幻影。
就在这时，光幕突然出现，画面中展现出了一场惊心动魄的历史画卷。原来，这一切的阴谋背后，是一个名为“暗影主宰”的存在。在宇宙诞生的初期，“暗影主宰”就孕育而生，它拥有着强大的黑暗力量和统治欲望，妄图将整个宇宙纳入自己的掌控之中。
而黑暗联盟不过是他分散出去的棋子，他利用各种手段挑起宇宙各文明之间的矛盾和冲突，引导它们走向战争，以便从中获取更多的黑暗能量，最终实现他统治宇宙的野心。
“没想到，我们对黑暗联盟的无尽追杀，竟然都在他的算计之中。”卡恩斯愤怒地说道。
“没错，我们必须联合所有文明，共同对抗这个‘暗影主宰’。只有团结一致，我们才有希望战胜这个宇宙的邪恶之源。”杨建波坚定地说。
就在他们准备离开神秘空间时，神秘小球体再次发光，它释放出一股神秘的力量，将光幕中的信息传递给了杨建波。杨建波获得了“暗影主宰”的弱点以及他的黑暗力量的来源。
杨建波与银河守护者联盟一同返回联军总部，将真相告知了所有文明。各文明的领导者们听闻真相后，纷纷表示愿意摒弃前嫌，共同对抗“暗影主宰”。
于是，一场全宇宙规模的联盟迅速形成。各个文明的联盟联合起来，汇聚了所有的智慧和力量，准备迎接与“暗影主宰”的最终决战。
在一个月黑风高的夜晚，联军舰队驶向“暗影主宰”所在的黑暗空间。舰队在星辰间穿梭，士气高昂。他们知道，这将是一场关乎宇宙命运的决战。
联军舰队包围了黑暗空间的能量漩涡，“暗影主宰”感受到了威胁，他释放出黑暗力量，向联军舰队发起了猛烈的攻击。然而，联军早有准备，他们运用各自文明的独特技术和武器，顽强地抵御着攻击，并逐渐找到了“暗影主宰”的弱点。
杨建波手持光剑，带领着最精锐的部队，冲向了能量漩涡的核心。“暗影主宰”发出愤怒的咆哮，他集中黑暗力量，向杨建波扑来。但杨建波凭借着光剑的力量和神秘小球体的加持，与“暗影主宰”展开了激烈的交锋。
最终，在所有联军的共同努力下，“暗影主宰”被彻底消灭，他那强大的黑暗力量消散在宇宙之中。
宇宙迎来了新的和平与秩序，各个文明在经历了这场磨难后，更加深刻地认识到团结与合作的重要性。杨建波的勇气和智慧成为了宇宙的传奇，他的名字将永远铭刻在宇宙的历史长河中。
而那枚预言水晶和神秘小球体，被放置在了宇宙的和平殿堂中，成为了守护宇宙和平的象征，时刻提醒着宇宙中的每一个生命，要珍惜来之不易的和平。