王允怒道：“董卓是逆贼，如今伏诛，士民无不欢庆。”
“这是什么人，竟敢为他哭？”
于是命武士：
“把那人给我抓来！”
不久，那人被擒至众官面前，众人见后无不震惊，原来此人竟是侍中蔡邕。
王允斥责道：
“董卓是逆贼，今日伏诛，是国家的大幸。”
“你身为汉臣，不为国家庆贺，反而为贼哭泣，这是为什么？”
蔡邕伏罪道：
“我蔡邕虽然无能，但也知道大义，岂会背叛国家向董卓效忠？”
“只是因为一时感念他的知遇之恩，不觉悲泣罢了。”
“我自知罪孽深重，愿大人赦免。”
“如果能黥面刖足，让我继续编修汉史，以赎罪孽，那便是我的幸事。”
众官因惜蔡邕才华，纷纷为其求情。
太傅马日密劝王允道：
“蔡伯喈乃旷世奇才，若能续成汉史，实为盛事。”
而且他素来以孝行闻名，若贸然杀之，恐怕会失去人心。”
王允却说道：
“当年汉武帝不杀司马迁，任其作史，结果留下谤书，流传后世。”
“如今国家气数已衰，朝政混乱，不能让小人执笔在幼主左右，否则我们将被他污蔑于后世。”
马日无言而退，却私下对众官感叹道：
“王公恐怕会绝后吧！”
“善良之人，是国家的根本；文史之作，是国家的典范。”
“灭根废典，国家怎能长久？”
当时王允不听马日之劝，最终下令将蔡邕投入监狱，缢死狱中。
一时间，士大夫闻者皆为之流泪。
后人论及蔡邕为董卓哭泣，固然有不对之处，但王允将他杀死，也未免太过。
有人作诗叹道：
董卓专权肆不仁，侍中何自竟亡身？
当时诸葛隆中卧，安肯轻身事乱臣。
且说李傕、郭汜、张济、樊稠逃至陕西，遣人至长安上表请求赦免罪过。
王允说道：
“董卓的专横跋扈，全是这四人助纣为虐所致。”
“如今虽大赦天下，但唯独不能赦免这四人。”
使者回报李傕。
李傕说道：
“既然求赦无望，我们各自逃命便是。”
谋士贾诩劝说道：
“诸位若是抛下军队独自逃亡，那即便是一个亭长也能将你们缚送官府。”
“不如聚集陕地百姓和你们的本部军马，杀回长安，为董卓报仇。”
“如果成功，就奉朝廷之名平定天下；若是失败，逃跑也不迟。”
李傕等人采纳了他的建议，遂在西凉州散布流言道：
“王允打算彻底铲除这一带的人！”
百姓闻言大惊失色，纷纷不安。
李傕等人又扬言：
“徒死无益，愿追随我者可免一死！”