1939年10月，刘茂恩任第十四集团军总司令，下辖其基本部队第十五军、高桂滋的第十七军、裴昌会的第九军和范汉杰的第二十七军，仍驻守晋南中条山区，属第二战区指挥管辖。1941年初，晋南中条山战区部队全部划归第一战区指挥。1941年春末中条山战役后，该集团军退过黄河，驻守河南。至1944年夏，该集团军总司令仍为刘茂恩，仅辖第十五军和谢辅三的暂编第四军。
1944年春，日军发动豫湘桂会战，第十四集团军的部队在洛阳保卫战中曾顽强抵抗日军的进攻。到1944年底，第十四集团军番号被撤销，其所属各部队由第一战区商南指挥所指挥管辖。
国民革命军第五集团军
1937年8月中旬奉令组建，首任集团军总司令为顾祝同、副总司令为上官云相，下辖第八军、第一军、第二十六军、第五十七军等部，属第五战区指挥管辖，淞沪会战爆发后，第八军、第一军等分别编入其他集团军战斗序列，顾祝同也调任第三战区副司令长官，直接指挥淞沪会战。
1938年夏，于学忠任第五集团军总司令，下辖其基本部队第五十一军和宋希濂的第七十一军。1938年底，于学忠奉令率部组建鲁苏战区。后第五集团军番号调归第二战区，由驻守山西南部中条山的中国军队编组而成，集团军总司令为曾万钟、副总司令刘茂恩，下辖北伐时就存在的朱培德系统滇军第三军、刘茂恩的河南土著部队第十五军、高桂滋的陕北土著部队第十七军，其基本部队为第三军。
1941年初，第五集团军及中条山战区部队划归第一战区指挥。此时，第五集团军仅指挥第三军和第九十八军。1941年夏中条山战役中，第五集团军总部及其主力第三军遭到惨重失败，第三军军长唐淮源、该军主力师第十二师师长寸性奇及大量官佐阵亡，1941年夏末，第九十八军在与日军作战中失利，9月29日，军长武士敏阵亡。后该集团军番号被撤销。
1943年4月后，第五集团军番号在昆明行营恢复，集团军总司令为杜聿明，下辖第五军、第八军等部，其基本部队为第五军，该军是中国陆军第一支机械化部队，是军事委员会直辖的机动主力作战部队，1939年底曾在广西昆仑关用苏式装备全歼日军主力第五师团第二十一旅团，击毙旅团长中村正雄。后参加第一次入缅远征军，著名的抗日殉国将领戴安澜就是第五军第二〇〇师师长。
国民革命军第九集团军
抗日战争是世界反法西斯战争的重要组成部分，中国抗日战场是同盟国在亚洲地面作战的主要战场，中国抗日军队在八年对日作战中，歼灭、消耗及牵制了日本法西斯的绝大部分陆军，为第二次世界大战及反法西斯战争的最后胜利作出了巨大的贡献。在整个抗日战争中，中国陆军先后编成40个番号的集团军参加对日作战。
1937年8月中旬在上海地区组建，首任集团军总司令为张治中先生，副总司令黄琪翔，下辖第三十六师、第八十七师、第八十八师，均系原国民政府警卫军，由德国顾问训练的精锐之师，是最早投入淞沪战场的部队，属第三战区指挥管辖。1937年8月13日，在淞沪战场最早阵亡殉国的黄梅兴将军就是第八十八师第二六四旅旅长。9月中旬，朱绍良接任第九集团军总司令，第十八师、第六十一师加入该集团军战斗序列，这时该集团军担任淞沪战场中央地段防守任务。坚守四行仓库的“八百壮士”就是由第八十八师第二六二旅第五二四团的官兵组成。10 月25日，该集团军第十八师师长朱耀华因所扼守的大场防线被突破，官兵伤亡惨重，无力恢复而自戕殉国，被警卫员扑上前去，子弹打偏，侥幸未死。后在南京保卫战中，该集团军第八十七师第二五九旅旅长易安华、第八十八师第二六四旅旅长高致嵩、第二六二旅旅长朱赤均阵亡殉国。1938年夏，第九集团军番号调归第九战区指挥管辖，集团军总司令为吴奇伟，下辖第六十四军、第七十军、第二十五军、第四军、第八军和第六十六军等部，驻扎江西，曾参加武汉会战，是万家岭大捷的主力参战部队，该战全歼日军四个联队。到1939年春，第九集团军只辖第四军、第四十九军，参加过南昌战役。1940年，第九集团军番号转归第四战区，集团军总司令为关麟徵，下辖第五十四军、第六军。1943年，第九集团军又调归昆明行营指挥管辖，关麟徵仍任集团军总司令，其起家部队第五十二军加入该集团军战斗序列。后第五十四军、第六军调离该集团军。1945年春，第九集团军及第五十二军奉令编入中国陆军总司令部直辖的、专门用于战略反攻任务的四个方面军中的第一方面军，关麟徵任第一方面军副总司令。