提前说明一下，不是我要故意要改设定，是game freak的设定太离谱了，要么就是模棱两可的不说清楚，得靠自己想象，更改设定也是为了故事能更好的写下去。
（希望大家看完设定后不要弃书，设定随时会变，希望大家多看几章再做决定，谢谢大家了！(′人)拜托）
世界观设定
十岁成年法早已废除（十岁就外出冒险还是太离谱了点）新法规定十六岁为成年，并规定年满十岁的孩子强制执行三年义务教育后才可以领取初始宝可梦后外出冒险。
但联盟鼓励人们继续学习直到十六岁后外出冒险，对坚持到十六岁后外出冒险的人可以免费在联盟饲育屋内挑选一只宝可梦。
宝可梦正式对战中限制四个技能，但宝可梦可掌握的技能不止四个。
帕底亚亚地区设定
1帕底亚学院作为全世界屈指可数的古老学校，学生的年龄层相当广泛，从小孩到大人都在这里学习，且课程几乎都与宝可梦有关。其中有些课程似乎还能和宝可梦一起上课。
学院内部包罗万象，人们可以在其中训练宝可梦，指挥宝可梦战斗，成为宝可梦训练家。也可以学习照顾受伤的宝可梦，成为宝可梦医生。同样也可以在此研究宝可梦的秘密，成为宝可梦研究员。
帕底亚学院就读满五年便可顺利毕业，也可以通过毕业考试提前毕业。
毕业考试大体可以分为三种。
第一种是在一年内集齐帕底亚地区七枚道馆徽章便可以毕业，集齐八枚还可以挑战帕底亚联盟，在打败四天王后即可成为冠军训练家。当然，如果一年内没有集齐六枚徽章则需要从头再来。
第二种便是提交论文，由学院老师组成的审核团审核通过后即可毕业。
第三种要求拥有一本高级证书，比如高级饲育家证书，高级宝可梦医疗证书，拥有一本即可毕业。
学生在提前毕业后也可在学院中继续学习，直到第五年学业结束。
2两位博士都在，奥琳博士和弗图博士各自研究古代种悖谬宝可梦和未来种悖谬宝可梦，在深入到第零区最深处时发现了太晶现象，经过二人的合理研究后在十年前完善了太晶化并研究出太晶珠，使得太晶化可以应用于宝可梦对战，之后将其技术交给了联盟，使得太晶化可以广泛应用。
同时在第零区最深处巨大水晶柱中二人发现被封其中的故勒顿和密勒顿，还有少量的悖谬宝可梦并将其解救出来，二人通过对巨大水晶柱的研究后在水晶柱内部深处研究出时光机，之后发现大量的悖谬宝可梦，两位博士通过研究各自写下带有自己id的朱之书和紫之书，
但没多久时光机失控，第零区的悖谬宝可梦泛滥。二位博士为了稳定时光机和清理泛滥的悖谬宝可梦带着故勒顿和密勒顿进入了第零区最深处，之后悖论宝可梦的泛滥得到控制但两位博士却没有回来，只留下二人的孩子派帕。
3故勒顿和密勒顿会同时出现，一只与原作主角相遇，一只和本作主角相遇。
4初始的朱之书和紫之书是二百年前探险家海哲所写，200年前，探险家海哲率领“第零区观测队”第一次成功到达巨坑底部，至此巨坑的底部开始被称为第零区，但在探险过程中遇到了很多怪异的事情，海哲将自己的经历撰写为了朱之书和紫之书。
5悖谬宝可梦暂时设定为由时光机从不同时空带来的宝可梦，类似究极异兽。