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上海的一些官僚想要染指淮军的指挥权。
这让李鸿章十分不满。
李鸿章现在在上海没有钱，又没有权，还要听别人的，所以部队运作起来就有点困难，处处受阻。
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上海表面上看，第一把手应该是吴煦和他的浙江帮，但是吴煦他的背后是江苏巡抚薛焕，而薛焕又是两江总督何桂清的部下。
现在何桂清倒台了，上海的实际话事人是江苏巡抚薛焕。
被这些上海爷们儿整的受不了，李鸿章想要夺权。
李鸿章于是偷偷的给安庆的曾国藩写信，寻求解决的方法！
曾国藩尝过被人牵着鼻子走的这种滋味。
他尝试过手底下有军队，但是粮草，军饷方面都要靠别人眼色，靠别人的施舍那种求人的滋味。
所以曾国藩是深深体会得到李鸿章现在是处境的。
再说上海的话事人是何桂清的部下薛焕，和自己不是一派，可以说是曾国藩政敌。
所以曾国藩对李鸿章的回信中直接写道：
“”你手底下有兵，你怕什么？，想要长期发展，就必须铲除上海地头蛇“”。
“”将上海的关税和厘捐到手“”
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随后曾国藩和李鸿章开始运作，曾国藩以两江总督的名义，给朝廷上了折子弹劾江苏巡抚薛焕。
曾国藩在折子说两江总督薛焕：
“”偏安一隅，物论滋繁，不能胜此重任“”
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（意思是 ：江苏巡抚薛焕贪生怕死，大家对他有许多不满，没有人说的好，根本就担不起江苏巡抚这样重要的责任）
曾国藩还在折纸中建议李鸿章代替薛焕升任江苏巡抚，好保卫上海。
朝廷本来就对江苏巡抚薛焕非常失望，薛焕如今躲在上海，毫无作为，将贪生怕死表现的淋漓尽致。
所以朝廷当局就同意了，撤除薛焕江苏巡抚的位置，让李鸿章担任江苏巡抚，
而薛焕连降两级, 成了李鸿章的部下，协助李鸿章守上海。
李鸿章得到江苏巡抚之后，开始以手下有兵，对上海各个官僚进行清算。
对于李鸿章如何打压上海，这已经属于政治对决的问题，所以我就不详细解说了。
李鸿章通过铁血手段，将吴煦，大买办杨坊的人，搞得服服帖帖的，一点脾气都没有。
李鸿章仅仅不到两个月的功夫，就将盘踞在上海各种错综复杂的官僚势力，全部清除，加以打击，可见李鸿章的手段之高明。
不过终究归底说来说，还是李鸿章枪杆子厉害。
逐渐控制了上海后，李鸿章开始疯狂练兵，日夜操练，为日后太平军进攻上海做准备。
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1862年1月。
李秀成带领谭绍光，郝永宽，李荣发，刘启云，共计十余万人，分五路大军，水陆并进逼近上海。
太平军第二次攻打上海的战役正式开始。
不过，这次李秀成吸取了第一次攻打上海作战失败的教训。