第41章：
基隆港东北方向的三座岛屿分别名为社寮岛、桶盘屿、中山仔岛，后世经填海连成一片，即为如今的和平岛。
第42章：
1、“蟒甲长三十余尺，中广约八尺，深半之，只一大木而剖其中，毫无增益，古制也，舟之始也。”——出自曹士桂《宦海日记》，作者在道光年间曾于北台湾任职。“蟒甲”即巴赛语独木舟之意，今之地名“艋舺”亦为此词音译。
2、“衣名‘几辘’，长至腰，毗布及达戈纹为之。下体围布二幅，亦名‘遮阴’，间有衣鹿皮者。”——出自《续修台湾府志》
3、“又男番喜穿耳，纳竹圈于中，渐易大者。久之，将垂及肩，乃实以圆木或嵌螺钱，各县社番多有之。”——出自《清职贡选图》
4、“发在周围者悉除之，中留圆顶，剪而下垂，状如头陀。”——出自《诸罗县志》。这种发型在北台湾原住民中很普遍，西部平原上也有束发或包头的。
5、“若夫平地近番，女择其所爱者，乃与挽手，挽手者以明私许之意也。明日，女告其父母，召挽手少年至，凿上颚门牙旁二齿授女，女亦盘二齿付男，期某日就妇室婚。”——出自郁永河《裨海纪游》。
6、关于基隆港的金包里社和大鸡笼社这两个贸易村社，西班牙史料里有记载。现在的新北市有一条金包里老街，这是清代金包里社的社址，应该是西班牙人侵占基隆后迁徙至此。据西班牙人记载，金包里社和大鸡笼社给他们留下了一千多座空屋子。
第43章：
“淡水地潮湿，番人作室，结草构成，为梯以入，铺木板于地，亦用木板为屋，如覆舟。”——出自《番俗六考》
第44章：
基隆金包里社源出于淡水沙巴里社来自西班牙人的记载，后收录于《淡水镇志》。
第45章：
1、“诰敕勘合及印信番本，逐一查验明白，果无冒伪影射情弊，方许具本起送。各番地方远近不齐，贡期不必拘以三年，但未及三年不许來贡，不愿者不强。”——出自《大明会典》卷一百八朝贡通例。
2、双屿即今舟山六横岛，烈港即今舟山金塘岛西北部的沥港。文中所言李旦、许心素为李光头、许栋后代，包括前文所言李旦被欧华宇所救均为小说虚构，并无史料支撑，但李、欧、许确为结义兄弟，在此一并说明。
3、嘉靖大倭寇虽然有不少是中国人，但其中的军事骨干基本都是日本人，经过正规军事训练，比如大友义镇的水军就直接参与了好几场战争，详见《明代倭寇史略》。直到隆万年间，大海盗林凤手下负责军事指挥的仍然是名为庄公的日本人。
第46章：
明代厦门岛上的驻军除了隶属于福建都司永宁卫的中左所外，尚有镇戍制营兵。其沿革如下：
景泰三年，浯屿水寨内迁至厦门，统兵将领为钦依把总。万历三十年再迁于晋江石狮；
隆庆四年，在厦门设立浯铜游兵，统兵将领为名色把总；
万历二十年，福建南路副总兵（原为守备，后改参将，嘉靖四十三年改副总兵）移驻厦门，统领标下三营（均为名色把总）、浯屿水寨、铜山水寨（钦依把总）、浯铜游兵，以及漳泉二府的海防卫所和巡检司；
天启二年因红夷犯境，在厦门设立泉南游击，下辖浯屿水寨、浯铜游兵。福建南路副总兵回驻铜山，仍辖标下三营、铜山水寨，听漳潮副总兵（驻地在广东潮州南澳岛）节制。
第47章：
“许心素为郑弁所杀，向传以为真也。职蒙台台委查，即讯之郑弁，语多两岐，则杀似未真。本府行票着伊家属跟要。而素之次男一龙，毙于狱矣。长男乐天，还窜久矣。”——出自《靖海纪略》，作者曹履泰曾在同安任知县五年（厦门当时属同安县）。该书主要由曹履泰在同安任上的公文整理而成，这一条是他在崇祯三年给时任福建右布政使陆之祺的信件。
第48章：
1、“海上之战无他术，大船胜小船，大铳胜小铳，多船胜寡船，多铳胜寡铳而已。”——出自俞大猷《正气堂集》
2、“驭兵无体，专以送礼厚薄为礼貌……不习波涛，登舟即时吐浪，是以一切船务不能查理……但闻警报一味畏缩”——出自朱一冯《为循例举劾澎湖守备游击王梦熊等员事》，收录于《明清台湾史料汇编》。以上均说的是时任浯铜游兵把总方献可。
3、李旦忽悠英国人的始末记载在柯克斯的日记中，该日记后来被整理成《平户英国商馆日记》，于上世纪五十年代出版。
4、李旦忽悠荷兰人及打劫前往大员船只的事见《荷兰联合东印度公司台湾长官致巴达维亚总督书信集》，该书于本世纪由台湾学者江树生等人整理翻译出版。
5、“彭湖既复，海甸方清，而夷倭交通，尚伏近岛，谨陈用间方略，以靖余孽，以永奠南陲”——出自《兵部题行条陈彭湖善后事宜残稿》。
第49章：
“芝龙不追、不杀、不焚、不掠，似有归命之意。”——出自《靖海录》
“今龙之为贼，又与禄异。假仁假义，所到地方，但令报水，而未尝杀人。有彻贫者，且以钱米与之。其行事更为可虑耳。”——出自《靖海纪略》
第50章：
1两万金指的是二万两白银，而非二万两黄金。
2“海道一员，驻扎宁波，巡海、兼理宁绍兵备，经营沿海卫所，管理水陆兵粮。”——出自《大明会典》李东阳撰，申时行重修。
3“浙江按察司佥事洪承畴为本省布政使司右参议宁绍兵备道。”——出自《明熹宗实录》，洪承畴于天启二年四月出任宁绍兵备道兼浙江海道，天启六年二月前后离任。