渡边见无法劝阻联队长，只能暗叹一声，将此事迅速上报。
与此同时，正与日军进行交战的第一联队、第五联队的官兵们都接到了来自联队本部命令，这些命令虽然在行文上有所区别，但竟然跟第二步兵联队的命令大体一致。
常石杀降事件的后果出现了。
对放下武器日军的大规模屠杀无疑刺激到了整个皇帝亲军，在部分极端军官的煽动和刻意组织下，事态向着大本营根本无法阻止、甚至无法预见的一面滑去。
第五步兵联队的一个中队在俘虏了几百日军之后，未经请示就将这些俘虏全部坑杀。
“由于日军的迅速瓦解，我皇军各部队的神勇快速推进，约有万余日本兵被切断了退路。他们丢下武器向我军投降。然我军兵力有限，要处理如此众多的俘虏，粮食方面的保证根本无法实现。因此，我擅自向所属各部队发出命令，要他们效仿常石事件，全部处决掉这些俘虏。”
本来负责收容俘虏的工兵联队长安国寺一夜之间处决了一万余俘虏。常石事件之前，安国寺曾向大本营进言，要善待俘虏。
第三步兵联队的一个大队俘虏了一千多日军，他们不知道怎么办，在听说后方发生了常石事件后，这个大队立即将俘虏们全部处决掉。
临时抽调入日的台湾警备师团第一步兵联队长魏广生是魏公公的九太爷，在到达日本编入第一军序列后，魏广生就经常与第一军各联队长联络。
常石事件没有发生前，魏广生就经常说干嘛要接受那些倭兵的投降，统统杀了不是省事得。早几十年前嘉靖爷那会，可不见倭寇对我皇明子民有善待的。老辈人可都说了，那东南沿海的百姓叫倭寇们祸害的惨了噢。
这等带有强烈复仇的言论自然引起了大本营参谋长官蒋西凤的反感，他向魏公公建议将其调离，但建议多次却未能获得同意。
此事令得魏广生产生错觉，以为他侄重孙是在默许他行事。于是，魏部一路可谓是烧杀抢掠，所过之处几成赤土。
又因魏部肃宁子弟众多，此后数月甚至长达两年，肃宁籍皇军官兵不断将从日本抢掠的财货运往家乡，使得从前的北直隶有名的贫困县摇身一变成了全省部名的富裕县。
多远的姑娘都要嫁到肃宁，意外的解决了肃宁两百年来的出太监的臭名，导致天启年间宫中太监定额大大不够。
九千岁魏忠贤对侄儿感慨道：“咱咧给皇爷做一辈子没能让家乡百姓过上好日子，你小子出海晃一圈倒是成了家乡的活菩萨咧。赶明让他们别再立咱的生伺了，都立你的，都立你的。”
最让大本营震怒的不是魏公公的九太爷，而是第一步兵联队长，也是常石事件的主要责任人真田一郎。
其在第一步兵联队官兵演说中公开宣称，说什么幕府的一切都是我们的敌人，哪怕山川草木也是！
常石事件之后，真田下发了一道密令，“凡在京都以及京都附近的战场，一般的日本百姓，纵令是老人、女人或者小孩，部队都要严加注意。近期不断发生我联队官兵被日军单独兵袭杀事件，故不能粗心胆大，需要特别注意，尤以后方部队为然。如果发现这些行为，一律不宽恕，必须采取断然处置。”
第六步兵联队长李炎昭宣称：“京都是日本的京都，也是皇明的京都。皇军对京都的占领是帝国意志的贯彻，因此不允许京都存在任何幕府的流毒！”