后来陆涛被科学家们弄回了未来，然后问了他具体情况，得知送错了年代科学家们都很失望。
第二次穿越，陆涛被送到了正确的时间。这一次他又遇到了关河，因为之前在疗养院的时候陆涛凭空消失，关河这几年一直都在找他。
关河听了陆涛关于未来的描述，虽然不完全相信，却决定跟着陆涛一起去寻找线索。
两人找到了生物学家袁锋的住所，在这里他见到了袁递，原来袁递是袁锋的儿子。陆涛虽然很意外，却没有多想，甚至还让袁递帮他注意谁会偷袁锋的病毒样本，如果有消息就告诉他。
但是后来陆涛和关河才发现，偷样本就是袁递，原来袁递当时听到陆涛说要消灭人类，一直把这件事记在心里，还为此做了计划，准备偷取父亲的病毒样品，然后释放出来。
得知一切的陆涛准备去阻止袁递，却在快要追到袁递的时候被关河杀死。
关河是一个传染病学医生，但是得不到重用，他希望能够让世人认识到病毒的厉害，这样他才能受到世人景仰。
而他之所以一直跟着陆涛，就是害怕陆涛改编历史。
的最后一幕，一个小男孩站在巷子口，目睹着巷子里面发生的一切，他就是小时候的陆涛。
……
闭环虽然用的是十二猴子的框架，但是在对时间的解答却有很大不同。十二猴子中，主角其实改变过历史，原本病毒应该是病毒学家的儿子散播的，因为主角的出现，儿子没得逞。
但是最终的结局却没有改变，只不过是散布病毒的人从病毒学家的儿子变成了助手。
然而闭环中却不是这样的，在这个故事中，一切过去都是不可改变的，或者说一切都是写好的剧本。时间是一个闭环，就像是一部拍好的电影循环播放。
在时间闭环理论中，时间是一个圆圈，既然是一个圆圈，那就没有前后之分。
“你以为自己在改变历史，其实你只是在重复历史。”
“过去和未来早已存在，早已冻结。”
于东还改了爱情戏份，美国人拍电影就是有个毛病，什么片子里面都要加入爱情戏码，就算是爱情戏份铺垫地不行，最后男女主都会走到一起。
还有科学家戏份，电影十二猴子中科学家根本不想拯救人类，之所以送主角回去，是为了确保病毒能够散播出去，这样他们这些科学家就能受到世人敬仰，获得极大的权利。
但是于东认为这一点有些不合逻辑，因为科学家如果真的为了这个，完全没有必要制造时光机送人回去，这样反而无端制造了历史会改变的风险。